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Clasificación y ordenación

 

Biocenosis: Hace referencia al conjunto de poblaciones de distintas especies que habitan en un lugar determinado interaccionando con él.

Asociaciones: Un conjunto menor del cual se pueden sacar datos estadísticos.

Afinidad entre especies

Afinidad. Nos indica diferencias o similitudes entre las variables, entre las muestras o sisteas. La información puede ser cualitativa o cuantitativa. Podemos obtener dos tipos de matrices: matrices de tipo Q, se muestran valores de similitud que existen entre las muestras; matrices de tipo R, se muestran similitudes entre los individuos.

Indice de afinidad

Índice de de Jaccard: Q = C/A + B + C; donde A es el número de muestras en las que está presenta la especie a; B indica el número de muestras donde está presente la especie b y C es el número de muestras comunes a mabos.

Los sistemas de clasificación también llamados dendogramas.

Algoritmo de Lance - Williams

La muestra que ha mostrado el máximo valor en la matriz de afinidad formará la primera rama:

dh,ij = 0'625 (dhi + dhj) - 0'25 dij

Si en un momento se unen dos ramas (2,6); el algoritmo nos indicará que muestras se unen o que muestras quedan al margen:

D 1,2.6 = 0'625 (d1,2 + d1,6) - 0'25 d2,6 = X
D 3,2.6 = 0'625 (d3,2 + d3,6) - 0'25 d2,6 = X'
D 4,2.6 = 0'625 (d4,2 + d4,6) - 0'25 d2,6 = X''
D 5,2.6 = 0'625 (d5,2 + d5,6) - 0'25 d2,6 = X'''

Se mira cual es la que proporciona el valor máximo, después se comprueba si existe algún valor en la matriz de afinidad que sea mayor que el máximo , este tiene que aparecer en las muestras en las que no se encuentren ni 2 ni 6. Si aparece algún valor mayor este formará un grupo independiente. Si no aparecen valores superiores, el valor máximo se tomará como referencia para seguir con la construcción.

Métodos de ordenación

Analisis de correspondencia: a partir de datos de presencia o ausencia

Analisis de componentes principales: para las muestras se emplean índices de distancia, para las variables se emplea el coeficiente de correlación

 

 

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